Regulação da edição genética usando T

Feb 15, 2024

Plantas da Natureza (2023)Cite este artigo

Detalhes das métricas

A transformação via Agrobacterium tumefaciens é o método predominante usado para introduzir DNA exógeno nos genomas das plantas . O DNA de transferência (T-DNA) originário de Agrobacterium pode ser integrado como uma única cópia ou em formas concatenadas complexas, mas os mecanismos que afetam a estrutura final do T-DNA permanecem desconhecidos. Aqui demonstramos que a inclusão de sequências derivadas de retrotransposon (RT) no T-DNA pode aumentar o número de cópias do T-DNA em mais de 50 vezes em Arabidopsis thaliana. Estas cópias adicionais de T-DNA são organizadas em grandes concatâmeros, um efeito induzido principalmente pelas repetições terminais longas (LTRs) de RTs que podem ser replicadas usando repetições de DNA não-LTR. Descobrimos que a concatenação do T-DNA depende da atividade das proteínas de reparo do DNA MRE11, RAD17 e ATR. Finalmente, mostramos que a concatenação do T-DNA pode ser usada para aumentar a frequência da mutagênese direcionada e do direcionamento genético. No geral, este trabalho revela determinantes moleculares que modulam o número de cópias de T-DNA em Arabidopsis e demonstra a utilidade de induzir a concatenação de T-DNA para edição de genes de plantas.

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Os dados gerados a partir deste estudo estão incluídos nas figuras principais, dados estendidos e Informações Suplementares. Os dados brutos de sequenciamento são depositados no NCBI SRA (BioProject PRJNA892619). A análise dos dados fez uso do genoma TAIR10 Arabidopsis (https://www.arabidopsis.org/download/index-auto.jsp%3Fdir%3D%252Fdownload _files%252FGenes%252FTAIR10_genome_release) e a lista de 'família de genes ortólogos' obtida do banco de dados Dicots PLAZA 5.0 (https://ftp.psb.ugent.be/pub/plaza/plaza_public_dicots_05/GeneFamilies/genefamily_data.ORTHOFAM.csv.gz). Não há restrições quanto à disponibilidade de dados. Os dados de origem são fornecidos com este artigo.

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